Клинический отдел организован в 1994 году.
        Лечебная и консультативно-диагностическая деятельность клинических кафедр ГБОУ ВПО КубГМУ Минздравсоцразвития России проводится в соответствии с «Основами законодательства Российской Федерации об охране здоровья граждан», приказом Министерства Здравоохранения РФ от 29 сентября 1993 №228 «Об утверждении Положения о клиническом лечебно-профилактическом учреждении», Уставом ГБОУ ВПО КубГМУ Минздравсоцразвития России и другими нормативными документами. Организация этой деятельности возложена на отдел клинической работы под руководством проректора по лечебной работе и последипломному обучению.