С 1991 года заведует кафедрой гигиены с экологией, доктор медицинских наук, профессор, «Заслуженный работник здравоохранения Российской Федерации», «Действительный член (академик) Международной Академии наук экологии и безопасности жизнедеятельности» (с 1994г.), «Заслуженный деятель науки и образования» РАЕ (2011г.), награжден нагрудными знаками «Ветеран труда» и «Отличник здравоохранения», имеет две государственные награды (медали). Выпускник Военно-медицинской академии им. С.М. Кирова (военно-морской факультет), г.Ленинград (1961г.).
С 1961 по 1965 годы проходил службу на кораблях и в частях Военно-морского флота (начальник медицинской службы, врач-токсиколог и др.).
С 1965 года работает в КубГМУ на кафедре гигиены с экологией (прежнее название – кафедра общей гигиены) сначала ассистентом, затем (с 1970г.) доцентом. В 1970 году защитил кандидатскую диссертацию на тему «Влияние ультрафиолетового излучения разной длины волны на свёртываемость крови». Докторскую диссертацию на тему «Гигиена труда женщин в индустриальном скотоводстве» защитил в 1990 году. Автор и соавтор более 380 публикаций (из них 91 статья в различных журналах), в том числе двух учебников для студентов вузов Российской Федерации. Это первое в стране коллективное пособие «Экология человека. Учебник для медицинских и фармацевтических вузов». — М.: ГОУ ВУНМЦ МЗ РФ. – 2001- 639 стр., (глава 11 «Применение пестицидов и здоровье населения) и учебник для студентов вузов РФ по направлению подготовки 49.03.01 – «Физическая культура» «Гигиенические основы физкультурно-спортивной деятельности». – М.: Издательство «Советский спорт». — 512 стр. с приложением в виде компакт-диска, (в соавторстве с профессором Г.А. Макаровой). Среди его публикаций семь изданий монографического типа: «Вопросы гигиены труда в сельскохозяйственном производстве».- Краснодар, 1980г.; «Пестициды, окружающая среда и здоровье населения».- Краснодар, 1999г.; «Здоровое питание: план действий по разработке региональных программ в России».- М., 2001г.; «Медико-экологический атлас Краснодарского края».- Краснодар: «Печатный двор Кубани», 2002г.; «Адекватное питание» / Под ред. Г.Т. Айдинова. – Ростов-на-Дону.-2005г.; «Гигиена и здоровье».–Краснодар–Сидней, 2009.–Краснодар: «ХОРС», 2009 г.; «Образовательная среда и состояние здоровья девушек-студенток медицинских колледжей».- Краснодар, «Славянка», 2012г. Он соавтор разработки и внедрения в народное хозяйство четырёх документов союзного и республиканского уровня внедрения с правом переиздания местными органами здравоохранения: «Охрана здоровья беременных женщин, занятых в животноводстве», МЗ РСФСР, Методические рекомендации. – Типография МО СССР.- М., 1987 г.; «Государственный санитарный надзор за условиями труда в промышленном животноводстве».- Методические указания, МЗ СССР.- Саратов,1987 г.; «Организация диспансерного обслуживания работников животноводческих комплексов промышленного типа» Метод. Рекомендации МЗ РСФСР.- Саратов,1989 г.; «Гигиена труда в индустриальном рисоводстве». Методические рекомендации.- МЗ РСФСР.- М., 1991г. Редактор и соавтор 13 учебно-методических руководств и практикумов (один из которых отмечен Почётной грамотой Минздрава) для студентов лечебного (из них 3 руководства на английском языке), педиатрического, медико-профилактического, стоматологического и фармацевтического факультетов.
Сотрудники кафедры под руководством заведующего подготовили и провели две научные конференции «Социально-экологические проблемы Кубани» с изданием материалов. Совместно с НИИ стандартизации был подготовлен проект Федерального закона о продуктах питания, разработаны методические рекомендации по гигиене труда механизаторов и животноводов. Подготовлены и изданы новые «Оценочные таблицы физического развития школьников г.Краснодара» (2000г.), буклет «80 лет кафедре гигиены Кубанской государственной медицинской академии», (2000г.), «Оценочные таблицы физического развития дошкольников г. Краснодара» (2006г.), «Применение шкал трудности учебных дисциплин для совершенствования организации учебного процесса в медицинских колледжах и училищах (2010г.), буклет «100 лет кафедре гигиены Кубанской государственной медицинской академии», (2020г.). Получены первые в истории кафедры 5 патентов на изобретения. Коллектив кафедры первой в стране явился инициатором организации и проведения учебных занятий по медицинской экологии для студентов выпускных курсов.
Профессор П.В. Нефёдов много лет работал в составе Всесоюзной проблемной комиссии «Гигиена труда женщин в сельскохозяйственном производстве», Республиканской комиссии «Научные основы гигиены села», Координационного учебно-методического Совета по экологическому образованию и воспитанию студентов медицинских и фармацевтических вузов РФ, в экспертных Советах Государственной научно-технической программы «Здоровье населения России», Краевого комитета по охране природы, в диссертационном совете при Ростовском медицинском университете.
В 1991-1993 годах профессор П.В. Нефёдов руководил СНО нашего вуза.
С 1994 по 1999 годы профессор П.В. Нефёдов, продолжая руководить кафедрой, работал проректором по учебно-воспитательной работе КГМА. По его инициативе и при непосредственном участии в вузе были открыты факультет повышения квалификации преподавателей, медико-профилактический и фармацевтический факультеты. В 1999-2008 гг. возглавлял деканат по работе с иностранными учащимися.
В последние годы научные интересы кафедры сосредоточены на проблеме гигиены детей и подростков.
Профессор П. В. Нефёдов – консультант докторской диссертации (В.А. Шашель), научный руководитель 5 кандидатских диссертаций (А.Г. Кунделеков, Л.Р. Парфенюк, А.А. Швец, Н.Б. Кутумова, А.М. Аслоньянц). В настоящее время под его руководством через аспирантуру подготовлены к защите ещё две кандидатские диссертации (Батракова Л.В. и Пчёльник О.А.).
Профессор П.В. Нефёдов является Лауреатом премии администрации Краснодарского края за достижения в области науки, заместителем председателя и членом Совета партнерства «Национального научного медицинского общества гигиенистов и санитарных врачей».
В 2020 году успешно прошел обучение на цикле «Технологии интенсификации и активизации обучения как средство повышения качества преподавания в образовательных организациях высшего образования. Психолого-педагогический аспект». В 2022 году прошел курс повышения квалификации по программам «Программа повышения квалификации преподавателей высшего и среднего профессионального образования по новым программам для ИТ-специальностей и различных предметных областей».
В настоящее время под руководством профессора П.В. Нефёдова на кафедре учебно-воспитательную, методическую и научно-исследовательскую работу ведут доценты Светлана Сергеевна Колычева, Алексей Геннадьевич Кунделеков, Людмила Рауфовна Школьная, старшие преподаватели Инга Станиславовна Захарченко, Ольга Юрьевна Манилова, Любовь Викторовна Батракова, ассистент Олег Александрович Пчёльник, старший лаборант Светлана Александровна Четверикова и лаборант Александра Александровна Савченко.