Кафедра педиатрии с курсом неонатологии основана 1 сентября 1985 года в составе факультета усовершенствования врачей Кубанского медицинского института.
С 1985 по 2008 год кафедру педиатрии с курсом неонатологии ФПК и ППС возглавлял профессор Л.А. Никулин.
С 2008 года кафедру педиатрии с курсом неонатологии ФПК и ППС возглавляет Клещенко Елена Ивановна доктор медицинских наук, профессор, главный врач ГБУЗ «Детская краевая клиническая больница», главный педиатр Краснодарского края, председатель регионального отделения Союза педиатров России. Является председателем Наблюдательного совета благотворительного фонда «Край Добра». Член ученого совета КубГМУ. Член центрального методического совета КубГМУ, член центральной проблемной комиссии. Председатель экспертной группы центральной аттестационной комиссии Министерства здравоохранения Российской Федерации в Южном федеральном округе по профилю «педиатрия». Член комиссий Министерства здравоохранения Краснодарского края. Заслуженный работник здравоохранения Кубани.
На сегодняшний день на кафедре работает 24 сотрудника, из них 1 профессор, 5 доцентов и 15 ассистентов.
За 40 лет работы кафедры, сотрудники провели огромную научную работу: опубликовано более 800 научных статей, тезисов, защищено 7 кандидатских диссертаций, написано более 40 учебных и учебно-методических пособий, несколько патентов, регулярное участие в конференциях.
Сотрудники кафедры выполняют большой объем лечебной работы: обходы больных, участие в консилиумах, проводят консультации, обходы больных, участие в консилиумах, проводят консультации,
Для осуществления лечебной работы у кафедры задействовано большое количество баз: ГБУЗ ККБСМП г. Краснодара, ГБУЗ Детская краевая клиническая больница МЗ КК, ГБУЗ Детская городская клиническая больница № 1, ГБУЗ Краевая клиническая больница № 2 МЗ КК, ГБУЗ Специализированная клиническая детская инфекционная больница МЗ КК.
Также базами кафедры являются детские поликлиники г. Краснодара, МБУЗ г. Сочи «Центр медицинской профилактики», МБУЗ «Детская ГБ УЗА МО город-курорт Анапа».
На кафедре проводятся циклы профессиональной переподготовки (ПП) и повышения квалификации (ПК) в рамках непрерывного медицинского образования (НМО) по нескольким направлениям для врачей: «Педиатрия», «Неонатология», «Детская кардиология», «Детская онкология-гематология».
Также есть циклы ПП и ПК для среднего медицинского персонала по специальности «Сестринское дело в педиатрии».
Проходят обучение аспиранты по педиатрии и ординаторы по педиатрии и неонатологии.
Занятия для всех обучающихся осуществляются с применением симуляционного центра на базе университета: ФГБОУ ВО КубГМУ Минздрава России Мультипрофильный аккредитационно-симуляционный центр.
С 2018 года пять раз в год кафедра организовывает краевые, межрегиональные, всероссийские, междисциплинарные научно-практические конференции, они проходят как в очном, так и в онлайн форматах.
В 2025 году кафедрой впервые организована Всероссийская Олимпиада по неонатологии.
